Oi Mariano, boa noite.
Desconheço qualquer recomendação formal da SAP, mas, em função das atualizações constantes da SEFAZ e necessidade de aplicação de SPs para NF-e com maior frequencia, seria interessante sim separar o PI corpartivo do PI NF-e.
Com relação ao alto volume do ambiente, sugiro consultar o material abaixo que foi muito útil no último projeto aonde tínhamos um ambiente robusto, mas o HA não estava devidamente configurado.
Abs.